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CodonCode Aligner Sequence Assembler 3.7.1

CodonCode Aligner Sequence Assembler 3.7.1

Herausgebers Beschreibung
Dateidetails
Antivirus-Bericht
Veröffentlicht von CodonCode Corporation am 2 Nov 2010

"Benutzerfreundliche Sequenzzusammenstellung und -ausrichtung"

CodonCode Aligner ist eine benutzerfreundliche Software für die Zusammenstellung, Ausrichtung, Bearbeitung und Erkennung von DNA-Sequenzen. CodonCode Aligner bietet nicht nur Funktionen, die in Sequenzassemblierungsprogrammen üblich sind, wie End-Clipping, Ausrichtung auf Referenzsequenzen, Ausrichtung von cDNA auf genomische DNA und Export, sondern auch viele einzigartige Funktionen, die in keiner anderen Software zu finden sind.
                              
            Zu den erweiterten CodonCode Aligner-Funktionen gehören:
            - Nach Namen zusammenbauen: Erstellen Sie Hunderte von Contigs in Sekunden anhand der Probennamen
            - Durch genaue Konsensussequenzen auf der Basis von Sequenzqualitäten müssen keine geringfügigen Abweichungen mehr bearbeitet werden
            - Contigs of Contigs: Richten Sie Contigs mit ClustalW aneinander aus und kehren Sie mit einem einfachen Doppelklick zu den zugrunde liegenden Traces zurück
            - Automatisieren Sie mit einstufiger Verarbeitung und Skripten
            - Sensitive Mutationsanalyse mit einzigartigen Tools zur Analyse heterozygoter Insertionen und Deletionen
            - Verwenden Sie führende Tools wie Clustal, MUSCLE, Phred & Phrap in CodonCode Aligner
            - Sehen Sie sich Ihre ABI-Sequenzen mit CodonCode Aligner genauer an
            - Unterschiede mit der Differenztabelle betrachten und Contigs zoomen
            - Erstellen Sie benachbarte Bäume, um Ihre Stichproben nach Unterschieden zu sortieren
                        
            CodonCode Aligner ist einfach zu erlernen und zu verwenden, jedoch leistungsstark und in hohem Maße anpassbar. Es enthält eine umfassende kontextsensitive Hilfe mit Anleitungen und Erläuterungen zu den verwendeten Algorithmen. CodonCode Aligner wird häufig in den Bereichen Phylogenetik, Evolutionsforschung, Biogeographie, Mutationsnachweis und anderen biomedizinischen Forschungsbereichen eingesetzt.
                  
            Der Download ist eine Testversion, die 30 Tage lang voll funktionsfähig ist. Es kann durch den Kauf einer Lizenz in eine Vollversion umgewandelt werden. Lizenzen für CodonCode Aligner sind wesentlich günstiger als Lizenzen für vergleichbare Softwarepakete. "Floating" -Lizenzen sind kostenlos und können von Windows und Mac OS X gemeinsam genutzt werden.

Bedarf Windows 2000 or newer, Mac OS X 10.4 or newer

Was ist neu in dieser Version?: New: Neighbor-Joining trees Zooming in alignments & assemblies Automatic reference sequence shortening after alignments Mask low coverage regions New and flexible consensus methods Set base numbers Automatic name scheme definitions for "Assemble & Align by Name" Customize toolbars directly through popup menus Rebuild the consensus See http://www.codoncode.com/aligner/new.htm

Antivirus-Informationen

Download3k heruntergeladen CodonCode Aligner Sequence Assembler am 22 May 2012 und überprüft es mit einigen der neuesten Antiviren-Engines. Hier ist der Scan-Bericht:

  • Avira:

    Sauber

  • Bitdefender:

    Sauber

  • Kaspersky:

    Sauber

  • NOD32:

    Sauber
CodonCode Aligner Sequence Assembler Antivirus Report
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